此后明朝数次在当地建立了专门镇压走私贸易的海防馆，却依然不见效果。不少有识之士也开始认识到对外贸易在经济面有很多益处，开始提议开放月港贸易。而更为重要的原因在于期望通过开放一个固定口岸来缓解沿海地区的倭寇问题，管理那些过去想管也管不到的海商。
在倭寇最为泛滥的嘉靖朝 不少倭寇就来自福建沿海地区
成为天子南库的月港新区
明穆宗隆庆皇帝
1567年，明穆宗隆庆皇帝继位。福建巡抚都御史涂泽民利用隆庆改元而政治布新之机，奏请在漳州月港开放海禁，准许中国商民出海贸易。这个提议很快得到隆庆皇帝的批准，历史上著名的“隆庆开关”正式开始。月港乃至所在的漳州也都一跃成为了明王朝试点改革的新区。
当然，作为已经运行了两个世纪的总体政策，，明王朝依赖土地产出的基本国策并是不存在根本性调整可能的。这样的做法对于一个庞大的农业帝国而言，也是具有颠覆性危险的。
因此，所谓的开关其实就紧紧是针对月港所在的漳州一地的开放。当局给本国商船的通行证不过是的每年50张，后来增加到了1575年的100张。1589年开始，把前往东西洋商船的总数各定为44只，每只需领引一份。后来由于申请出海者太多了，又将船引扩大到110份。到十六世纪末时，才在漳州地区的居民获准下西洋贸易之外，再特许泉州地区居民去到东洋贸易，以免非本地人以各种手段作假参合进来。
开关后的月港新区
