其实这两个官职光从名称上看，就能看出两江总督官职是比江苏巡抚高的。总督是指国家某一片区域的最高行政长官，，这一官职从明朝时期就开始设立了，到清朝时期一共有九大总督。从官名上可以看出，这一职位并不是地方官，而是中央派遣的大员，以便集中皇帝权力、实行统一管辖。
清朝时地方行政实行督抚制，全国有23个省，每个省一名巡抚，主管全省民政，是一省的最高长官，相当于现在的省委书记。清朝时的两江总督，官居从一品，是大清九个最高级的封疆大臣之一，职位可以说相当高了。两江总督管理的区域是江苏（含现在的上海）、安徽、江西三省。而江苏巡抚管理的区域是南直隶（也就是江苏和安徽全境，包含现在的上海），从管理的范围上就能看出，两江总督的官职更大。
总督的权力虽然比巡抚要大得多，但是二者之间并没有隶属关系，这两个官职都是直接受皇帝管辖的。
除了职位有高低，这两个官职管理的事情也各有侧重。总督的权力侧重于军事，而巡抚的权力主要在民政上，从职务的侧重点不同，也能看出两江总督的官职是比江苏巡抚高的，毕竟军事权必须要掌握在统治阶层手里，堪称统治者的“命根子”，所以两江总督更受皇帝的信任，在这个职务上，皇帝也会派一些自己十分信任的人去担任。比如曾国藩、曾国荃、刘坤一、张之洞等人都曾经担任过这一重要职务。
