乾隆收复新疆后，设置了伊犁将军，让他统领新疆当地的军政大臣。军事、政务两把抓，，帮助朝廷统辖好这片土地。
如果把伊犁将军跟全国其他驻扎在各地的将军相比，它统辖的面积是最大的，需要处理的事务也是最多的。
从官员选拔到整顿军备，收缴赋税，保障当地百姓生计。这些都是伊犁将军需要做的。虽然是一个武职，但它也要负责文官的事务。
这里所需的人才，必须要可以处理应付当地各样事务，并且得到皇帝的信任。毕竟这么大一片土地，又是边疆。如果不是绝对信任的人，很难放心。
伊犁将军由皇帝直接任命，任期则取决于皇帝的信任程度。虽然清朝末年时，新疆设立了巡抚。但他们之间并不是互相同属。伊犁将军依然有非常重要的分量。
