然而朱由检刚愎自用，做事还犹豫不决，多疑又决断不力，一次次的做了错误的决定，1628年开始，旱灾，蝗灾，鼠疫接踵而至，而百姓的赋税并没有减少，一时间各地明辨不断，1628年朱由检做了一个决定，那就是精简驿站，于是李自成就失业了之后一系列的事件把李自成推到了明王朝的对立面，而当时大明王朝还有一个敌人是后金，1629年，袁崇焕反击皇太极有功，却被皇太极使用反间计，朱由检下令将袁崇焕凌迟处死大名，失去了一员大将之后的形势就节节败退。
1644年战争达到了顶峰，大明王朝都有捡大清王朝，顺治大顺王朝，李自成三方进行了最后的决战，李自成率领农民军率先的攻进了北京城，3月18日，李自成逼近北京城，朱由检命令王琛领禁卫军迎战，当时大势已去，城门守卫寥寥无几，李自成让士兵架起云梯，集中的攻击西直门，平则门，德胜门王承恩见贼兵将至，开炮攻打，竟然杀死了数人，但毕竟兵力不足，抵挡不住敌军的进攻。
